Bioorganic & Medicinal Chemistry
医薬品らしい低分子の物性とRNA構造の特徴が、選択的なRNA結合にどう関係するかを検討し、RNA標的化合物設計への示唆を示した研究です。
CITATIONHiroki Yoshida, Ryosuke Nagasawa, Kaoru R. Komatsu. Physicochemical and RNA structural features of selective RNA binding by drug-like small molecules. Bioorganic & Medicinal Chemistry, 2026. https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0968089626001033
Nature Communications
一塩基変異がRNA構造と低分子の相互作用をどう変えるかを検出する、シーケンシングベースのBIVID-MaP法を報告した研究です。
CITATIONEmi Miyashita, Kazumitsu Onizuka, Yutong Chen, Hiroki Yoshida, Hina Hatayama, Shunya Ishikawa, Peijie Yan, Takahito Hasegawa, Mamiko Ozawa, Kaho Maeta, Fumi Nagatsugi, Hirohide Saito, Kaoru R. Komatsu. Systematic identification of variant-specific RNA structure-small molecule interactions exemplified by RNA G-quadruplexes. Nature Communications, 2026. https://www.nature.com/articles/s41467-026-70097-9
RSC Chemical Biology
RNAへの結合をそのまま蛍光として読み出すG-clampプローブを報告し、RNA結合低分子のスクリーニングに蛍光の読み出しを与えた研究です。
CITATIONRyosuke Nagasawa, Kazumitsu Onizuka, Ryohei Iwata, Kosuke Tsuzuki, Kaoru R. Komatsu, Emi Miyashita, Sayaka Dantsuji, Hirotaka Murase, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi. RNA-binding fluorogenic probes: G-clamp conjugated with a thiazole orange derivative for screening RNA-binding small molecules. RSC Chemical Biology, 2026. https://doi.org/10.1039/d5cb00078e
Chemical Communications
大規模なRNA結合プロファイルを手がかりに結晶化する複合体を選び、G-clamp誘導体とRNAの複合体の結晶構造を決定した研究です。
CITATIONRyosuke Nagasawa, Kazumitsu Onizuka, Karen Kawamura, Kosuke Tsuzuki, Hirotaka Murase, Kaoru R. Komatsu, Emi Miyashita, Hirohide Saito, Jiro Kondo, Fumi Nagatsugi. Crystallographic analysis of G-clamp–RNA complex assisted by large scale RNA-binding profile. Chemical Communications, 2025. https://doi.org/10.1039/d4cc04677c
Communications Chemistry
多重化RNA構造ライブラリを用い、多数のRNAモチーフに対する低分子の親和性と選択性を並列に解析できることを示した研究です。
CITATIONRyosuke Nagasawa, Kazumitsu Onizuka, Kaoru R. Komatsu, Emi Miyashita, Hirotaka Murase, Kanna Ojima, Shunya Ishikawa, Mamiko Ozawa, Hirohide Saito, Fumi Nagatsugi. Large-scale analysis of small molecule-RNA interactions using multiplexed RNA structure libraries. Communications Chemistry, 2024. https://www.nature.com/articles/s42004-024-01181-8
Nature Communications
多重化RNAモチーフライブラリを用いて、広い構造空間から機能的なRNA–低分子相互作用を探索する基盤を示した研究です。
CITATIONKaoru R. Komatsu, Toshiki Taya, Sora Matsumoto, Emi Miyashita, Shunichi Kashida, Hirohide Saito. RNA structure-wide discovery of functional interactions with multiplexed RNA motif library. Nature Communications, 2020. https://www.nature.com/articles/s41467-020-19699-5