化合物ライブラリ

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xFOREST RNA-focused Compound Library

2つのスクリーニング技術はいずれも大規模かつ網羅的で、1サイクル回すごとに「どの化合物が構造化RNAに結合し、どれが結合しなかったか」という記録が蓄積します。私たちはこのビッグデータをケモインフォマティクスで解析し、次世代のライブラリを組み直してきました。保有する17万を超える化合物のうち、構造化RNAに結合しやすくdrug-likeな6万以上が、この選抜を4世代重ねた現在のライブラリです。特徴は、どの世代も前の世代のスクリーニング結果から選ばれていることです。

ライブラリ選抜のループ 上段:3つのステーションがループを描く。棒の積層で描いた化合物ライブラリ、金のヒットセルを1つ含む小さな行列で描いたスクリーニング、六角形で描いた選抜。左から右へターコイズの矢印で結ばれ、ライブラリへ戻る帰還矢印が輪を閉じている。帰還矢印には次世代・反復と注記がある。下段:小さな化学のマークが長く連なり、そのうち数個だけが金で拾い出されている。結合化合物の中で濃縮されていた部分構造・骨格のクラスを示し、これがループによって次のライブラリへ持ち込まれる。 LIBRARY SCREEN SELECTION NEXT GENERATION  ×n ループが持ち帰るもの 結合化合物で濃縮された化学クラス 次のライブラリへ持ち込む
選抜ループの模式図。ステーションの絵柄、マークの位置と個数は説明のためのもので、実測データではありません。
入力
市販のケミカルスペースと、これまで実施した全スクリーニングのヒット/非ヒットの記録
出力
構造化RNAへの結合を学習した次世代の化合物ライブラリ
役割
1ウェルに構造化RNAが読み取れる化合物が入っている確率を上げること
効果
RNA構造に対するヒット率の向上、ヒット化合物の親和性・選択性の向上
RNAフォーカスド ライブラリ60,000+
保有化合物 総数170,000+
選抜サイクル4
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4世代、 上がり続けるヒット率

第1世代は多様性ライブラリでしたが、以降の世代はいずれも、前の社内スクリーニングからのデータをもとに学習を行い、組み立てられ、そのたびに前の世代より高いヒット率の達成に成功しています。我々の本当の強みはこの改善ループにあると自負しています。

4世代のライブラリにおけるヒット率 共通のベースライン上に、左から右へ高くなる4本の棒。最初の最も低い棒はターコイズで多様性世代と記され、その高さがチャート全幅に破線で伸びて比較の基準線になっている。より高い3本は金で描かれ、その上の括弧は、これら3世代が合わせてRNAへ向けて選抜された6万以上の化合物にあたることを示す。各世代の呼び名と説明はチャート下のリストにある。縦軸は相対値で、数値は付けていない。 HIT RATE · RELATIVE 60,000+ FOR RNA DIVERSITY BASELINE G1 G2 G3 G4
4世代にわたる傾向の模式図。棒の高さは変化の向きのみを示します。縦軸は相対値で意図的に目盛りを持たせておらず、値は実測データではありません。